1. 逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法
如果增值稅扣稅憑證逾期是由以下客觀原因造成的：發生自然災害、社會突發事件等不可抗力原因的；
納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務登記的時間過長，導致增值稅扣稅憑證逾期的；
企業辦稅人員擅自離職，未辦理交接手續的，可向稅務機關提出申請，報送相關資料，經過稅務機關審批后方可抵扣。手續很繁瑣，有一定難度。
2. 增值稅扣稅憑證抵扣期限有關規定
增值稅專用發票的認證期限是180天，在這個期限內認證通過的發票，抵扣是沒有期限的。
國稅函[2009]617號規定：
一、增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發票、公路內河貨物運輸業統一發票和機動車銷售統一發票，應在開具之日起180日內到稅務機關辦理認證，并在認證通過的次月申報期內，向主管稅務機關申報抵扣進項稅額。
二、實行海關進口增值稅專用繳款書（以下簡稱海關繳款書）“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關繳款書，應在開具之日起180日內向主管稅務機關報送《海關完稅憑證抵扣清單》（包括紙質資料和電子數據）申請稽核比對。
3. 逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題
看看你符合規定的那條理由，把原因寫明白就行了，寫的誠懇點。 國家稅務總局《關于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》國家稅務總局公告2011年第50號 為保障納稅人合法權益，經國務院批準，現將2007年1月1日以后開具的增值稅扣稅憑證未能按照規定期限辦理認證或者稽核比對（以下簡稱逾期）抵扣問題公告如下： 一、對增值稅一般納稅人發生真實交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，經主管稅務機關審核、逐級上報，由國家稅務總局認證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續抵扣其進項稅額。 增值稅一般納稅人由于除本公告第二條規定以外的其他原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，仍應按照增值稅扣稅憑證抵扣期限有關規定執行。 本公告所稱增值稅扣稅憑證，包括增值稅專用發票、海關進口增值稅專用繳款書和公路內河貨物運輸業統一發票。 二、客觀原因包括如下類型： ?。ㄒ唬┮蜃匀粸暮?、社會突發事件等不可抗力因素造成增值稅扣稅憑證逾期； ?。ǘ┰鲋刀惪鄱悜{證被盜、搶，或者因郵寄丟失、誤遞導致逾期； ?。ㄈ┯嘘P司法、行政機關在辦理業務或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，納稅人不能正常履行申報義務，或者稅務機關信息系統、網絡故障，未能及時處理納稅人網上認證數據等導致增值稅扣稅憑證逾期； ?。ㄋ模┵I賣雙方因經濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證，或者納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務登記的時間過長，導致增值稅扣稅憑證逾期； ?。ㄎ澹┯捎谄髽I辦稅人員傷亡、突發危重疾病或者擅自離職，未能辦理交接手續，導致增值稅扣稅憑證逾期； ?。﹪叶悇湛偩忠幎ǖ钠渌樾?。 三、增值稅一般納稅人因客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，可按照本公告附件《逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法》的規定，申請辦理逾期抵扣手續。 四、本公告自2011年10月1日起執行。 特此公告。 附件：逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法 國家稅務總局 二○一一年九月十四日 附件 逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法 一、增值稅一般納稅人發生真實交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，可向主管稅務機關申請辦理逾期抵扣。 二、納稅人申請辦理逾期抵扣時，應報送如下資料： ?。ㄒ唬队馄谠鲋刀惪鄱悜{證抵扣申請單》； ?。ǘ┰鲋刀惪鄱悜{證逾期情況說明。納稅人應詳細說明未能按期辦理認證或者申請稽核比對的原因，并加蓋企業公章。其中，對客觀原因不涉及第三方的，納稅人應說明的情況具體為：發生自然災害、社會突發事件等不可抗力原因的，納稅人應詳細說明自然災害或者社會突發事件發生的時間、影響地區、對納稅人生產經營的實際影響等；納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務登記的時間過長，導致增值稅扣稅憑證逾期的，納稅人應詳細說明辦理搬遷時間、注銷舊戶和注冊新戶的時間、搬出及搬入地點等；企業辦稅人員擅自離職，未辦理交接手續的，納稅人應詳細說明事情經過、辦稅人員姓名、離職時間等，并提供解除勞動關系合同及企業內部相關處理決定。 ?。ㄈ┛陀^原因涉及第三方的，應提供第三方證明或說明。具體為：企業辦稅人員傷亡或者突發危重疾病的，應提供公安機關、交通管理部門或者醫院證明；有關司法、行政機關在辦理業務或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，導致納稅人不能正常履行申報義務的，應提供相關司法、行政機關證明；增值稅扣稅憑證被盜、搶的，應提供公安機關證明；買賣雙方因經濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證的，應提供賣方出具的情況說明；郵寄丟失或者誤遞導致增值稅扣稅憑證逾期的，應提供郵政單位出具的說明。 ?。ㄋ模┯馄谠鲋刀惪鄱悜{證電子信息； ?。ㄎ澹┯馄谠鲋刀惪鄱悜{證復印件（復印件必須整潔、清晰，在憑證備注欄注明“與原件一致”并加蓋企業公章，增值稅專用發票復印件必須裁剪成與原票大小一致）。 三、由于稅務機關自身原因造成納稅人增值稅扣稅憑證逾期的，主管稅務機關應在上報文件中說明相關情況。具體為，稅務機關信息系統或者網絡故障，未能及時處理納稅人網上認證數據的，主管稅務機關應詳細說明信息系統或網絡故障出現、持續的時間，故障原因及表現等。 四、主管稅務機關應認真審核納稅人所報資料，重點審核納稅人所報送資料是否齊全、交易是否真實發生、造成增值稅扣稅憑證逾期的原因是否屬于客觀原因、第三方證明或說明所述時間是否具有邏輯性、資料信息是否一致、增值稅扣稅憑證復印件與原件是否一致等。 主管稅務機關審核無誤后，應向上級稅務機關正式上報，并將增值稅扣稅憑證逾期情況說明、第三方證明或說明、逾期增值稅扣稅憑證電子信息、逾期增值稅扣稅憑證復印件逐級審核后上報至國家稅務總局。 五、國家稅務總局將對各地上報的資料進行審核，并對逾期增值稅扣稅憑證信息進行認證、稽核比對，對資料符合條件、稽核比對結果相符的，通知省稅務機關允許納稅人繼續抵扣逾期增值稅扣稅憑證上所注明或計算的稅額。 六、主管稅務機關可定期或者不定期對已抵扣逾期增值稅扣稅憑證進項稅額的納稅人進行復查，發現納稅人提供虛假信息，存在弄虛作假行為的，應責令納稅人將已抵扣進項稅額轉出，并按《中華人民共和國稅收征收管理法》的有關規定進行處罰。
4. 增值稅專用發票逾期抵扣
1.直接把這張增值稅專用發票入帳,但是無法進行進項稅額認證抵扣;只能將稅額計入庫存商品一同入帳;也就是相當于損失了0.17的稅額了。
2.如果要求供應商重開發票的話,只有先通過開具紅字發票才能再重新開具正確的藍字發票的;因為專用發票隔月是無法作廢的。
5. 逾期申報抵扣憑證政策規定
專票不抵扣有影響。開出去的增值稅專用發票抵扣期限360天，如果逾期未抵扣金稅系統通過自動比對，發現形成滯留票，稅務機關會追究未抵扣原因，稽查雙方賬目。
對于開票方來說，按照發票管理辦法相關規定，應以依法開具發票為準則；至于依法開出的專票，受票方未予認證抵扣的，一般與開票方沒有直接關聯；可見，開票方只需依法依規進行開票則可。
6. 增值稅逾期抵扣政策
發生這類問題還是比較少見的，尤其是人為因素導致超期未認證，因為負責經辦發認證票管理的一般都是專職/專業的會計人員，若有發生那以后務必記住要及時認證掉，堅決避免人為失誤發生，那么發生增值稅專用發票過期未認證進項稅如何處理呢？
按以下辦法處理：
1、增值稅專用發票超期沒有認證抵扣的進項稅額，所涉進項稅由于過期未認證而不得抵扣，一般的做法是將該進項稅額與發票價款一并計入相應的成本費用當中進行列支，也就是把增值稅專用發票當成普通發票來使用了。
2、因為客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，只要是業務發生真實交易的，還是可以找主管稅務機關處理，一般流程經主管稅務機關審核、逐級上報，由國家稅務總局認證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續抵扣其進項稅額?！靖鶕秶叶悇湛偩株P于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》（國家稅務總局公告2011年第50號）文件】
上述所稱“客觀原因”包括如下情況：
（一）因自然災害、社會突發事件等不可抗力因素造成增值稅扣稅憑證逾期；
（二）增值稅扣稅憑證被盜、搶，或者因郵寄丟失、誤遞導致逾期；
（三）有關司法、行政機關在辦理業務或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，納稅人不能正常履行申報義務，或者稅務機關信息系統、網絡故障，未能及時處理納稅人網上認證數據等導致增值稅扣稅憑證逾期；
（四）買賣雙方因經濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證，或者納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務登記的時間過長，導致增值稅扣稅憑證逾期；
（五）由于企業辦稅人員傷亡、突發危重疾病或者擅自離職，未能辦理交接手續，導致增值稅扣稅憑證逾期；
（六）國家稅務總局規定的其他情形。
結論：發生了增值稅專用發票過期未認證，應如何處理，請結合自身實際情況，然后分析判斷下一步的工作，希望對你有幫助。